1． 选址。考察地质、地貌、水文、自然资源、人文资源、有关法律及公众意见。应因地制宜，尽量选择有一定自然坡度的洼地或经济价值不高的荒地，一方面减少土石方工程、利于排水、降低投资，另一方面防止对周围环境产生影响。
2． 确定系统组合形式。根据场地特征、处理要求和所处理污水的性质来确定。单一式、并联式、串联式、综合式。
3． 确定水力负荷。根据文献或经验而定。
4． 选择植物。根据湿地植物的耐污性能、生长能力、根系的发达程度以及经济价值和美观等因素来确定。一般有芦苇、席草、大米草、水葫芦、水花生等，最为常用的是芦苇，插植密度为1～3株/㎡。
5． 计算表面积as＝q/a as－表面积；q－进水量；a－水力负荷。
6． 确定长宽比。（1）表面流湿地：长宽比10：1或更大，根据地形来考虑，底坡降0％～1％。（2）潜流湿地：根据达西定律q＝ks×a×s s－水力坡度；a－湿地床横截面积；ks－潜流渗透系数。
7． 结构设计。
（1）进水系统的布置：湿地床的进水系统应保证配谁的均匀性，一般采用多孔管和三角堰等配水装置。进水管应比湿地床高出0.5m。湿地的出水系统一般根据对床中水位调节的要求，出水区的末端的砾石填料层的底部设置穿孔集水管，并设置旋转弯头和控制阀门以调节床内的水位。
（2）填料的使用：湿地床由三层组成 表层土层、中层砾石、下层小豆石。表面土钙含量在2～2.5kg/100kg为好；砾石层粒径在5～50mm，铺设厚度在 0.4~0.7m。
（3）潜流式湿地床的水位控制：当接纳最大设计流量时，进水端不能出现填料床面的淹没现象；有利于植物生长，床中水面浸没植物根系的深度应尽可能均匀。